根据提供的信息，工资12000元应缴纳的个人所得税计算如下：
1. 起征点为5000元；
2. 应纳税所得额 = 工资收入 - 起征点 = 12000 - 5000 = 7000元；
3. 适用税率为10%，速算扣除数为210元；
4. 应缴纳的个人所得税 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数 = 7000 × 10% - 210 = 700 - 210 = 490元；
5. 实发工资 = 应发工资 - 所得税 = 12000 - 490 = 11510元。
所以，工资12000元应缴纳的个人所得税为490元