深圳海关的隶属机构包括以下这些：
1. 罗湖海关
2. 文锦渡海关
3. 皇岗海关
4. 沙头角海关
5. 蛇口海关
6. 大鹏海关
7. 深圳机场海关
8. 笋岗海关
9. 梅林海关
10. 福田保税区海关
11. 南头海关
12. 同乐海关
13. 沙湾海关
14. 布吉海关
15. 现场业务处
16. 驻深圳经济特区办事处
17. 驻深圳出口加工区办事处
18. 驻邮局办事处
19. 驻三门岛办事处
20. 惠州海关
21. 惠州港海关
22. 惠东海关
23. 深圳湾海关
24. 深圳福田海关
25. 深圳大铲湾海关
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