市属事业单位与市直事业单位的主要区别在于管理层次和直属关系：
管理层次
市直事业单位通常由市委或市政府直接管理，具有较高的行政级别和执行力。
市属事业单位则不由市委或市政府直接管理，而是由相关部门或市属机关单位委托管理。
直属关系
市直事业单位直接隶属于市委或市政府，例如市委党校、档案馆等。
市属事业单位的人财物虽然由市里统筹，但在业务上可能由市教育局等其他部门负责指导。
职能与性质
市直事业单位可能承担政府的行政职责，成为参公管理人员机构，或提供教育、医疗、文化等公共服务。
市属事业单位在业务上可能更加专注于某一领域或行业，提供更多的自主权和灵活性。
经费来源
市直事业单位多为全供单位，即全部经费由财政拨款保障。
市属事业单位的经费来源可能有所不同，部分可能为全供，部分可能为差供管理单位。
简而言之，市直事业单位在行政级别、资源配置和任务执行上通常具有较高的权威性和执行力，而市属事业单位则在业务执行上可能具有更多的自主权和灵活性