在小说《完美世界》中，重瞳和至尊骨都是极为罕见和强大的天赋。根据提供的信息，重瞳通常被认为更为尊贵，原因如下：
稀有度：
重瞳者数量稀少，在小说《完美世界》中，活着的重瞳者仅有石毅和重瞳女两人，而整部小说中重瞳眼的出现次数也仅有五只，远低于至尊骨。
最终成就：
重瞳者的最终成就相对稳定，多数重瞳者可以达到仙王境，而拥有至尊骨的人虽然多，但最终成就却相差甚远。
持久度和上限：
重瞳者在小说后期依然能展现出强大的实力，例如石毅在重瞳的帮助下能够秒杀仙王，而至尊骨随着主角石昊能力的增强，其增幅作用逐渐减小。
能力多样性：
重瞳不仅可以演化武器，还能开辟一方小世界，并有助于恢复伤势，而至尊骨的能力相对单一，主要是对身体强度的增幅。
主角因素：
虽然至尊骨在石昊手中表现出了强大的能力，但石昊的成功部分归因于他的主角光环和多次至尊骨的再生。在没有这些特殊条件的情况下，重瞳的天赋似乎更为出色。
综上所述，虽然至尊骨在小说开始时显得非常强大，但重瞳以其稀有性、稳定的最终成就、持久的威力和多样的能力，在多数情况下被描绘为更为尊贵的天赋。