增值税采用抵扣制度的原因主要包括以下几点：
避免重复征税：
增值税是对商品或服务在生产、流通和消费过程中增值部分征收的税。通过抵扣机制，企业可以将购买原材料、设备或服务时支付的增值税从应纳税额中扣除，确保消费者最终承担的税负只涵盖增值部分。
促进专业化协作和分工：
增值税的抵扣制度鼓励企业间的合作和分工，因为企业可以通过抵扣机制减少税负，从而更依赖专业供应商和服务商。
提高经济效益和透明度：
增值税的抵扣制度允许企业根据实际业务活动和经济决策调整税收负担，提高了税收系统的透明度，企业可以通过财务报表和税务报表清楚地了解应缴税额和可抵扣税额。
确保税收的合规性：
增值税票作为合法的税务凭证，是纳税人进行抵扣的重要依据，税务部门通过增值税票的开具、传递和验证等环节，确保税收的合规性。
反映交易的合法性：
增值税票记载了货物和服务的流转过程及相应的税额，反映了交易的合法性，确保了税收的公正性。
简化税收计算：
增值税只对增值部分征税，进项税相当于成本，只有销项税额减去进项税额后的差额才是增值部分应交的税额，这种计算方法体现了按增值因素计税的原则。
需要注意的是，增值税抵扣制度的设计是为了确保税收的效率和公平性，同时激励经济发展和专业化分工。一般纳税人可以使用增值税专用发票进行进项税额的抵扣，而小规模纳税人通常只能使用普通发票