事业单位在招聘时可能会设置户籍限制，主要有以下几个原因：
地方保护主义：
地方政府为了保障本地就业率和稳定增长，可能会对事业单位的招考设置户籍限制，以保护本地人才不被外地人才挤压。
客观现实需要：
考虑到公务员和事业单位工作的稳定性，以及外地人员可能面临的生活压力，如买房、结婚等，地方政府可能设置户籍限制以减少这些压力。
人才稳定性：
公务员和事业单位队伍的稳定性非常重要，限制户籍可以减少外地人员流动带来的不稳定因素，确保队伍的连续性和效率。
编制限制：
地级市和县级市的事业单位编制有限，为了优先满足本行政区划内的就业需求，可能会对岗位设置户籍要求。
吸引高端人才：
为了吸引具有高学历的人才，一些地方政府在事业单位招聘中会设置例外，如对研究生及以上学历的求职者不限制户籍。
考试公正性：
虽然近年来对考试公正性的要求提高，限制户籍的可能性极小，但在特殊情况下，如某些特殊岗位或限定在某省户口之内，仍可能存在户籍限制。
需要注意的是，这些原因可能因地区和时间的不同而有所变化，具体情况需要参考当地的政策和招聘公告