南京理工大学江阴校区和本部校区的主要区别包括：
学科设置
本部校区学科设置全面，覆盖理工、经济、管理、文学等多个领域。
江阴校区重点在理工科学科，设有机械工程、电子信息等专业，以及文科如新闻传播专业。
师资力量
本部校区拥有以海内外高层次人才为主体的高水平师资队伍。
江阴校区师资队伍以年轻教师为主，提供了未来提升的可能性。
学生管理
本部校区学生组织活跃，社团结构完善，社交活动丰富。
江阴校区社交活动相对较少，受限于资源和地理位置。
办学地点与规模
本部校区位于南京市，是主校区。
江阴校区位于江苏省江阴市，成立于2013年，占地约1000亩。
招生与毕业证书
招生时，各校区有不同的招生代码，录取分数线也不同。
江阴校区的毕业证书与本部校区一致。
办学重点
本部校区聚焦核心办学功能提升。
江阴校区聚焦国家战略实施和国际化办学。
院系设置
本部校区设有机械工程学院、化工学院等。
江阴校区设有中法工程师学院、网络空间安全学院等。
其他差异
本部校区学生外出较为自由。
江阴校区请假制度较为严格。
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