总公司撤销分公司的流程通常包括以下几个步骤：
股东会决议：
总公司需召开股东会，并作出撤销分公司的决议。
查账与清算：
对分公司进行财务查账，并制定清算方案。
提交申请：
向分公司的公司登记机关提交注销登记申请，并提供必要的文件，如股东会决议、清算报告等。
税务注销：
注销分公司的税务登记证，包括国税和地税。
注销营业执照：
在获得公司登记机关的批准后，收缴分公司的营业执照。
注销其他证件：
如组织机构代码证等，并在相应的质量监督机构进行注销。
公告通知：
通过媒体或报纸公告分公司的注销情况，通知债权人及公众。
处理债权债务：
确保所有债权债务关系得到妥善处理。
完成备案：
在工商部门完成分公司撤销的备案手续。
以上步骤完成后，分公司的法律实体将被正式注销。需要注意的是，具体流程可能因地区和相关法规的差异而有所不同，建议在操作前咨询当地工商和税务部门获取详细信息