处理事业单位纠纷通常有以下几种方式：
协商解决：
当事人之间可以直接进行协商，尝试达成一致。
劳动监察部门投诉：
如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉，请求其介入调查和处理。
劳动仲裁：
若投诉无果，可以向单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，由仲裁委员会调查后出具调解书或裁决书。
法院诉讼：
对仲裁结果不满意，可以在规定时间内向法院提起诉讼，请求法院依法审理并作出判决。
申请执行：
如果一方不履行仲裁裁决或法院判决，另一方可以向法院申请强制执行。
人事争议处理：
对于事业单位人事争议，如考核结果、处分决定等不服，可依照国家有关规定申请复核或提出申诉。
请根据具体情况选择合适的解决方式。若有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告知