乡镇事业编与县级事业编的主要区别包括：
定义不同
乡镇公务员：在乡镇级政府部门工作，行使国家行政权利和执行国家公务的公务员。
乡镇事业单位：为乡镇提供社会公益服务，满足文化、教育、卫生等社会需求，经费由国家事业费开支。
岗位不同
乡镇公务员：在乡镇的党委政府机关中工作，职级包括乡级正职、乡级副职、主任科员、副主任科员、科员、办事员等。
乡镇事业单位：岗位结构比例由政府人事行政部门和事业单位主管部门确定，通常包括专业技术岗位和管理岗位。
聘用方法不同
乡镇公务员：通过省级公务员考试进行招录，转正后办理公务员登记。
乡镇事业单位：通过事业单位公开招聘考试进行招聘，录用后签订《事业单位聘用合同》。
编制性质不同
乡镇公务员：使用行政编制，编制落在乡镇的党委政府机关中。
乡镇事业单位：使用事业编制，编制落在乡镇党委政府下属的事业单位中。
发展前途不同
乡镇公务员：有领导职务提拔和职级晋升两条路线。
乡镇事业单位：实行岗位管理，发展路线包括管理岗位晋升和专业技术岗位晋升。
待遇和工作强度
乡镇事业单位：相比县级事业单位，可能多了乡镇津贴，但工作强度相对较大。
以上是乡镇事业编与县级事业编的主要区别。