大红斑是木星上一个著名的反气旋风暴，其红色的原因尚未完全解开，但科学界有多种理论尝试解释这一现象：
气体混合物：
大红斑内部的气体混合物可能含有更多的磷、硫或其他有机物质，这些物质在太阳光照射下可能发生光化学反应，产生红色。
温度差异：
大红斑内部较高的温度可能导致云层中的物质发生结晶或蒸发，使得云层变得更薄，从而让深层的红色物质更容易被观测到。
气流分布：
大红斑内部的强气流可能导致云层中物质分布不均匀，造成不同区域的云层呈现出不同的颜色。
化学反应产物：
有实验模拟表明，大红斑中的上升气流可能形成云后，层中的放电现象或化学反应可能导致了红色。
内部释放的化合物：
木星大气层中的氨和烃类物质在紫外线作用下可能参与反应，形成红色的未知物质。
持久的风暴系统：
大红斑可能是一个持久的飓风系统，其持续存在可能与木星快速的自转、强烈科里奥利力以及赤道-极地温差等因素有关。
以上解释均基于科学研究和对木星大气的观测，但确切原因仍有待进一步研究。大红斑作为木星上最显著的特征之一，其研究对于理解气态巨行星的气候系统和动力学具有重要意义