会计专业的毕业生在考取公务员时，可以选择以下部门的相关岗位：
财政部门：
包括财政局、税务局等，主要负责国家财政预算、税收征收与管理、财务审计等工作。
审计部门：
如国家审计署及其下属审计机关，负责对国家机关、事业单位、企事业单位、金融机构等进行审计监督和财务管理评估。
金融监管机构：
例如中国银行业监督管理委员会（银监会）、中国证券监督管理委员会（证监会）等，负责金融机构的监管。
税务机关：
包括国税和地税合并后的税务机关，负责税收政策的制定与执行、税务稽查、纳税服务等。
其他相关部门：
如经贸主管部门、外经贸主管部门、发改委、人民银行、证监会、银监会、保监会等，涉及财务管理、审计、税务等职位。
会计专业毕业生可以根据自己的兴趣和能力，选择合适的职位，并准备相关的知识和技能以应对公务员考试。具体的岗位选择可以参考当年公务员考试招录职位表