耶鲁大学与国内大学的合作十分广泛，涵盖了多个学科领域和合作形式。以下是一些合作实例：
生物医学科学项目
耶鲁大学与中国国家留学基金委员会合作设立了“中国留学基金委—耶鲁世界学者生物医学科学项目”，旨在培养能够对中国生物和生物医学研究作出重大贡献的学术带头人。
校际合作协议
例如，山东大学与耶鲁大学签署合作协议，在学生和教师交流、田野考古、实验室研究等方面开展合作。
浙江大学与耶鲁大学达成“3+2”联合学位项目，合作培养生命科学领域的优秀人才。
师生互访与交流
耶鲁大学与湘雅医学院建立直接合作关系，加强互派师生交流学习工作。
新学院设立
耶鲁大学与新加坡国立大学合作创建“耶鲁—国大学院”（Yale-NUS College），提供新型的人文素质教育。
联合学位与项目
清华大学与耶鲁大学在环境学院领域合作，实施双硕士学位项目。
综合提升合作
中南大学与耶鲁大学的合作有助于为学生提供优质教育资源，提升学术水平和研究能力，并促进学术交流。
这些合作不仅促进了学术和科研方面的交流，也为学生提供了跨国学习和研究的机会，有助于提升他们的国际视野和竞争力