用人单位查询员工学历信息通常有以下几种方式：
学历证书审核：
要求提供学历证书原件或复印件，并核查证书上的学校名称、专业、毕业时间等信息。
教育部学历查询系统：
通过中国高等教育学生信息网（学信网）验证员工的学历真伪。需要员工提供学历证书编号和身份证号码，进行在线验证。
第三方学历验证服务：
委托专业的第三方背景调查公司来验证员工的学历。
直接联系学校：
通过员工的毕业院校查询学历信息，可能需要员工授权或合作。
线下核实：
派人前往相关学校或教育机构进行现场核实。
云端数据库系统：
使用云端数据库系统查询员工的学历及其他信息。
学校图书馆或档案馆：
在某些情况下，企业可能通过学校图书馆或档案馆查询学历信息。
人才服务中心或市场：
作为辅助手段，通过人才服务中心或市场鉴定文凭的真伪。
请根据具体情况选择合适的查询方式