含有生物化石的岩石主要是沉积岩。沉积岩是由风化作用、火山碎屑、有机物及少量宇宙物质经过搬运、沉积和成岩作用形成的层状岩石。在沉积岩的形成过程中，由于环境相对温和且稳定，生物遗体、遗物或遗迹可以被保存下来，最终形成化石。
砂岩：由砂粒紧密结合形成的岩石。
石灰岩：主要由生物遗骸（如贝壳）的钙化作用形成。
页岩：由微小的泥土颗粒紧密结合形成，可能含有化石。
砾岩：由较大的岩块或矿物颗粒紧密结合形成。
硅藻土：由硅藻等微小生物的遗骸堆积形成，含有丰富的化石。
需要注意的是，虽然沉积岩是最常见的含有化石的岩石类型，但在某些情况下，变质程度较浅的副变质岩中也可能找到化石。