清末的学制主要包括两部重要的教育制度，即壬寅学制和癸卯学制：
壬寅学制
公布于1902年（光绪二十八年），也被称为《钦定学堂章程》。
虽然正式公布，但并未实行。
包含《钦定京师大学堂章程》、《钦定高等学堂章程》、《钦定中学堂章程》、《钦定小学堂章程》、《钦定蒙学堂章程》以及《考选入学章程》。
癸卯学制
公布于1904年（光绪二十九年），也被称为《奏定学堂章程》，是清政府真正实行的新学制。
学制将整个学程分为三个层次：初等教育13年，中等教育5年，高等教育11年左右。
包含蒙养院4年，初等小学堂5年，高等小学堂4年，中学堂5年，高等学堂3年，分科大学堂3年到4年，通儒院5年。
提倡德、智、体“三育”并举，并规定各级各类学堂均需开设体操课程。
1907年，清政府开放女禁，颁布《女子小学堂章程》和《女子师范学堂章程》，标志着女子教育在学制上取得合法地位。
这些学制标志着中国近代教育制度的开始，并为中国现代教育体系的形成奠定了基础