科隆大教堂的内部结构非常宏伟且具有特色，以下是其主要特点：
内部空间：
科隆大教堂内部空间挑高又加宽，采用五进式结构，与常见的教堂三进式结构不同。这种设计使得内部空间更加宽敞，给人以开阔感。
柱子与拱顶：
教堂内部由多个拱门和飞梁组成，每个拱门下面都有一根柱子支撑，柱子之间用飞梁相连，形成了坚固的结构。拱顶的设计增加了建筑物的稳定性，并让建筑物看起来更加轻盈和灵动。
尖塔与采光：
教堂中央有两座与门墙连砌在一起的双尖塔，高度分别为157.31米和157.38米，是全欧洲第二高的尖塔。教堂内部装饰有彩色玻璃，四壁装有描绘圣经人物的彩色玻璃，钟楼上装有5座响钟，其中最重的钟重达24吨。
装饰与细节：
科隆大教堂的装饰细部也都用尖券作主题，使建筑风格与结构手法形成有机整体。拱顶上面再加一层整体的陡坡屋面，内部是一个多柱大厅，每一根主柱周围都有拱墙相对应，通常是五拱，也有三拱和七拱的设计。
音乐与氛围：
教堂内部有管风琴，几乎每走10步都能看到一个小型管风琴悬立在整个建筑的上方。音乐在这里显得亢奋，与一些其他教堂的优雅缓慢的音乐风格不同。
科隆大教堂的内部结构不仅体现了哥特式建筑的特点，还融合了德国教堂自己的特色，被誉为哥特式教堂中最完美的建筑典范之一