日语专业的毕业生可以考虑报考以下公务员职位：
1. 外交部：需要掌握外语技能，包括日语。
2. 科技部：涉及科技合作相关工作，需要具备日语能力。
3. 商务部：负责国际贸易事务，需要掌握多种语言，包括日语。
4. 海关：涉及进出口管理部门等，需要日语能力。
5. 税务局：包括国家税务局和地方税务局，可能需要日语能力。
6. 文化局或外事办：涉及文化交流或外事工作，需要日语沟通能力。
7. 招商引资部门：各级政府机关的招商引资相关部门，可能需要日语商务沟通能力。
8. 日本文化专员：负责推广日本文化，需要具备日语和文化知识。
具体的报考职位和条件，请根据当年的公务员招聘公告和职位表来确定，因为每年的职位和要求可能会有所变化。