差额拨款是指政府为特定政策或项目在预算中拨出的资金，这些资金需要根据实际执行情况进行不同程度的拨付或调整。具体来说，差额拨款是财政只承担部分资金，剩余部分由事业单位自筹。这种方式旨在增加单位的经费自主管理能力，促进自收自支，减少对国家财政的依赖。差额拨款单位的人员费用由国家财政拨款，其他费用如办公经费等由单位自行解决。
差额拨款单位通常包括医疗卫生机构、科研单位、教育单位、文化单位等，它们提供社会公益服务，不以盈利为目的。差额拨款单位的人员工资构成中，固定部分通常为60%，非固定部分为40%。
差额拨款制度有助于提高事业单位的经费使用效率和透明度，并鼓励这些单位逐步减少对财政拨款的依赖，向经费自收自支的方向过渡