方阵中中间层指的是位于方阵中间的一层。在实心方阵中，中间层指的是位于中间的一层实心方块；而在空心方阵中，中间层指的是位于中间的一层空方块。
以您提供的参考信息为例，如果一个空心方阵共有5层，那么第三层就是中间层。根据方阵的定义，每一层的每边人数比外层少2人（因为每边各减少1人）。如果最外层每边有16人，那么中间层每边的人数将是16 - 2 = 14人。但是，由于这是空心方阵，我们需要计算的是中间层的总人数，而不是每边的人数。
对于空心方阵，总人数可以通过计算所有层的总人数来得到，通常使用等差数列求和公式或平方差公式。以您提供的参考信息中的例子，如果中间层有44人，那么整个方阵的总人数将是中间层人数乘以层数，即44 × 5 = 220人。
因此，根据您提供的信息，方阵中中间层是每边有12人的空心方阵，整个方阵共有5层，总人数为220人