扬州大学的合并是一个复杂的过程，涉及多方面的原因和考量。以下是一些主要因素：
资源整合：
合并的初衷是为了整合资源，提高学校的实力和影响力，希望得到国家的重点关照，以期有更好的发展前景。
经济因素：
扬州的经济实力相对较弱，合并后形成的“扬州大学”品牌能在招生时吸引更多考生，有助于提升教育质量和学校声誉。
政策导向：
中国的教育资源主要由政府主导，政府的投入需要与其政策相呼应。在政策层面上，将资源集中于一个三线城市如扬州显然不是最优选择。
机构臃肿：
合并后，扬州大学的机构变得臃肿，这可能对其管理效率和发展方向造成影响。
211高校名额竞争：
在1996年竞选211高校时，扬州大学未能成功，失去了省属211高校的名额，这对其后续发展产生了长远影响。
管理挑战：
合并过程中遇到了诸如管辖权问题、学科间隔阂、教师间距离和文化差异等挑战，这些都需要有效解决才能发挥合并后的最大效益。
发展定位：
有教育专家指出，高校的发展不在于规模大小，而在于特色和质量的提升。扬州大学在追求规模的过程中可能忽视了这一点。
综上所述，扬州大学的合并是一个由多种因素驱动的决策，旨在通过资源整合提升学校整体实力，但同时也面临管理、定位和发展上的挑战。