南京经济相较于一些城市如广州存在差距，其原因可以从多个方面进行分析：
产业结构问题
南京的四大支柱产业中，有三个出现衰退，包括电子信息制造业、汽车产业、石油新材料和钢铁行业。
相比之下，杭州的支柱产业如文化、旅游休闲、金融服务、生命健康、高端装备制造业则保持稳定增长。
地理和战略定位
南京虽不直接沿海，但依靠长江航运，可以视作准沿海城市。然而，随着沿海海运的崛起，上海成为经济交通中心，削弱了南京的地位。
南京在江苏的地理区位偏西南，与上海这个长三角的经济中心相比，其经济地位受到一定影响。
经济转型难度
历史上南京有大量国企和机关企业，在市场经济转型初期，这些企业限制了南京的经济转型，导致其错过了发展的关键时期。
城市规划和环境因素
南京地形南北狭长，北部有老山，影响了发展纵深。化工行业等高污染产业对周边环境造成影响，限制了城市发展。
政策与虹吸效应
上海作为中国经济中心，具有强大的虹吸效应，可能吸走了本属于南京的资源，影响了南京的经济发展。
科教文卫定位
从民国时期开始，南京定位于科教文卫行政作用的城市，地方重点也偏向于发展苏锡常经济，导致其工业经济发展相对不足。
内部体制和管理问题
有关南京内部体制僵化、管理不善的批评，如官员过于注重短期业绩而忽视长期发展，影响了城市的经济活力。
人均GDP考量
尽管南京的总GDP不及一些城市，但人均GDP可能与这些城市有较大差异，反映了经济发展水平的不同。
总结来说，南京经济落后于广州等城市的因素是多方面的，包括产业结构不合理、战略定位不够准确、城市规划和环境限制、内部体制和管理问题等。要改善南京的经济状况，可能需要从这些方面入手，进行深入的改革和发展策略调整