日本蔬菜和水果价格较高的原因可以归纳为以下几点：
地理因素
日本国土面积狭小，山地和丘陵占比较高，平原面积有限，导致可用于种植的土地资源稀缺。
种植成本
农业是劳动密集型产业，需要大量人力投入，而日本劳动力成本较高，限制了农业的大规模发展。
自然因素
日本常受台风、连续降雨、低温和地震等影响，对蔬菜种植造成不利影响，产量不稳定，价格波动大。
流通环节成本高
蔬菜从田间到市场需要经过采摘、运输、仓储和销售等多个环节，这些环节的成本在日本较高。
农业保护政策
日本政府为保护本国农业，对进口蔬菜水果设置高关税和非关税壁垒，限制国外农产品进入，维持国内农产品价格。
品质要求
日本蔬菜和水果讲究高品质，生产过程中采用无农药有机栽培、精细管理，增加了生产成本。
市场竞争激烈
日本市场上商品选择多，消费者对品质和服务的追求导致价格敏感，价格波动频繁。
农协制度
日本农协（全国共済農業協同組合連合会）控制着农业生产和销售体系，保障了果品质量，但也赋予了农协较高的市场定价权。
稀缺性
日本的气候环境并不利于所有水果的生长，导致某些品种的水果稀缺，增加了其市场价值。
特殊品种和高品质
日本一些特色水果如“晴王”哈密瓜等，由于其生长条件苛刻和精细栽种，产量低，品质高，价格昂贵。
以上因素综合作用，导致了日本蔬菜和水果价格相对较高