海南的主要码头包括：
三亚凤凰岛国际邮轮码头 ：位于三亚市，提供国内外邮轮停靠服务。海口港
秀英港区：
海南省的交通枢纽和客货集散中心，属国家一级开放口岸。
马村港区：主要负责货运。
新海港区：海南主要的客货滚装码头。
文昌清澜港：
海南省五大港口之一，拥有火箭发射场设备运载码头和多个旅游泊位。
三亚港：
位于海南省南部，是海上丝绸之路的战略港口之一。
洋浦港：
位于海南省洋浦经济开发区境内，水陆交通便利。
潭门码头：
位于海南省东部沿海地区，是海南岛最大的渔业远海捕捞港口。
南港：
位于海口市秀英区滨海大道顶端，主要服务对象为粤海铁路。
其他码头：
如儋州的白马井渔港、文昌的清澜湾环球码头、琼海的潭门港、万宁的和乐镇港北码头等。
这些码头在海南的港口运输和旅游中扮演着重要角色。