深圳户籍人口与常住人口之间存在差距，主要有以下几个原因：
高房价和生活成本：
深圳的平均房价非常高，平均工资水平相比之下较低，导致许多人买不起房，增加了生活成本。
资源紧张：
随着人口的增长，深圳的公共设施如住房、教育、医疗面临巨大压力，资源紧张。
落户门槛提高：
为了优化户籍增量人口结构，深圳提高了入户条件，比如要求更高的学历，这使得一部分人难以满足条件，无法落户。
积分落户要求：
积分落户需要满足一定的积分要求，如学历、社保缴纳年限等，这对非全日制学历或学历较低的人群来说是一个挑战。
公共资源紧缺：
由于落户人数增多，学位、医疗等公共资源变得紧缺，这也是积分入户迟迟未能开放的原因之一。
人才政策调整：
深圳的人才政策由过去的人口野蛮增长转向更注重引进高学历人才，中专以下学历的人群入户变得更加困难。
以上因素综合作用，导致深圳户籍人口增长缓慢，与常住人口之间存在较大差距