生物工程专业的毕业生在报考公务员时，可以考虑以下岗位：
环境监察管理岗：
负责环境污染、生态破坏等情况的监督调查和处理工作。
食品药品监察岗：
监管食品、药类的安全、质量和使用范围。
质量监督局：
涉及产品质量的监督和管理。
海关：
可能涉及动植物检疫等相关工作。
卫生局：
负责公共卫生和疾病控制等相关工作。
基层工商行政管理：
涉及生产要素市场监管及监测。
林业有害生物监测：
森林资源管理和有害生物监测。
动物防疫监督：
动物疫病的预防和控制。
海洋渔政管理：
海洋渔业资源的管理和保护。
其他不限专业的公务员职位：
部分省市的县区级别公务员一般不做专业限制。
在报考时，应关注职位表中的专业要求，选择与自身条件相符的岗位。同时，也可以考虑报考事业单位中相关岗位，例如质监局、药检所、种畜检疫中心等。