税务局稽查局科员主要负责税务稽查工作，具体职责包括：
1. 参与税务稽查工作，核查和审计纳税人的税务申报和缴纳情况，发现并处理违法违规行为。
2. 协助上级主管部门开展税收政策宣传和税务咨询服务工作，为纳税人提供税务咨询和服务。
3. 负责税务稽查工作中的文件、档案管理和数据统计工作，确保工作的规范和有序进行。
4. 参与税务稽查工作中的调查取证、听证和处理纠纷等工作，保证工作的公正性和合法性。
5. 完成上级主管部门交办的其他工作任务。
此外，税务局稽查科的工作还包括组织拟订并完善税务稽查工作规程及相关业务规定，对税务稽查法律法规、部门规章及规范性文件进行解释，协同立法、公安、检察和审判机关及其他有关部门解决税务稽查和涉税刑事案件的法律适用和司法解释问题，以及组织、协调、督办税收违法案件的查处。
需要注意的是，税务局稽查局科员的工作内容可能因地区、时间以及具体职责分配而有所不同。