燕京大学被拆分的原因主要是新中国成立后的政策调整。1952年，中国进行了全国范围内的高等院校院系调整，这一调整是为了适应新中国不允许外国人在国内办学的方针，并学习苏联的教育模式。燕京大学作为一所著名的私立教会大学，其资产和学科被整合到其他国立大学中，具体来说：
文科和理科被并入北京大学。
工科被并入清华大学。
经济学系被并入中央财经学院（今中央财经大学）。
法学院被并入北京政法学院（今中国政法大学）。
民族学系、社会学系、语文系（民族语文系）、历史系被并入中央民族学院（今中央民族大学）。
燕京大学的校园，即燕园，被北京大学接收，成为北京大学的校址。燕京大学因此结束了其历史使命，不再作为一所独立的大学存在