巨野县并不归属于济宁市，而是隶属于菏泽市。巨野县和济宁市在历史上确实有着深厚的渊源，但它们在行政上属于不同的地级市。以下是巨野县和济宁市的历史背景：
历史归属
巨野县在历史上大部分时间属于济宁管辖，特别是在元朝至元八年（1271年）时，巨野被升为济宁府，济宁的名字来源于此。
济宁的名字首次出现于元朝，而在此之前，巨野地区被称为济州。
地理位置变迁
由于黄河水患的影响，巨野县历史上曾多次被淹，这也是济宁（原济州）治所从巨野搬到任城（今济宁市任城区）的主要原因。任城位于地势较高的地区，相对安全，因此更名为济宁，寓意安宁和安居乐业。
现代行政划分
新中国成立后，巨野县最初属于平原省湖西专区，后随行政区划调整，巨野县一直属于菏泽市管辖。
济宁市则隶属于山东省济宁市，两者在现代行政划分中各自独立。
综上所述，巨野县之所以不归济宁市，是因为它在现代行政划分中属于菏泽市，而济宁市则属于山东省的另一个城市。两者虽然有着悠久的历史渊源，但在现代行政区划中已经分开