当时不守南京的原因主要包括以下几点：
防御力量不足：
日军在淞沪会战之后锐不可当，而当时中央军主力多在上海作战，南京缺乏能有效抵挡日军的部队。
战略失误：
战役战略上的失误让日军有机会在杭州湾登陆，包抄国军侧翼，迫使国军仓促撤退，无法有效防守南京。
政治考量：
南京作为国民政府的首都，是政治、经济、军事的中心，蒋介石守南京也有出于政治面子的考虑，不想不战而弃首都。
军事部署：
蒋介石虽有守卫南京的决心，但军事部署上存在不足，主力部队多已撤往上海，对南京的防守并不十分上心。
后续战略：
蒋介石已暗中布置主力调往东南及西南地区，并考虑退守台湾，表明其战略重点不在南京，而在京沪杭地区及台湾作为支撑。
高级将领意见：
许多高级将领不支持死守南京，建议集中兵力于武汉等重要地区，以保腹心地带及中国的半壁江山。
综合以上因素，不守南京是当时多方面考虑的结果