由原子直接构成的物质主要包括以下几类：
金属单质：
例如铁（Fe）、铜（Cu）、金（Au）、汞（Hg）等。
稀有气体单质：
例如氦（He）、氖（Ne）、氩（Ar）、氪（Kr）、氙（Xe）等。
非金属固体：
例如硅（Si）、碳（C）、磷（P）、硫（S）等。
原子晶体：
例如二氧化硅（SiO₂）、金刚石、碳化硅（SiC）等，这些物质中的原子通过共价键直接构成晶体结构。
这些物质在自然界中以纯净的形态存在，并且具有特定的物理和化学性质。需要注意的是，虽然金属和非金属固体中的原子直接构成物质，但有些非金属单质如磷，在常温下通常以氧化物的形式存在