日本留学热门院校推荐如下：
国立大学
东京大学
世界排名前十五，理科和工科世界领先。
培养了多位诺贝尔奖得主和日本政界领袖。
京都大学
亚洲排名第二，世界排名前三十。
几乎所有专业都很强，被称为“科学家的摇篮”。
东北大学
亚洲排名第三，世界排名54。
医学、工学、理学等领域享有盛誉。
大阪大学
国立大学，位于大阪府，全国排名第三。
工学院在光电子学、微波、半导体等领域国际评价高。
名古屋大学
学科全面，研究能力强。
北海道大学
以海洋科学和生命科学等领域著称。
九州大学
综合实力强，多个学科排名靠前。
筑波大学
以科学技术研究为主，特色明显。
神户大学
商学、法学等领域有较高国际声誉。
早稻田大学
私立大学，历史悠久，以政治经济、文学、商学等学科著称。
庆应义塾大学
私立大学，历史悠久，以法学、文学、经济学等学科著称。
上智大学
私立大学，与日本早稻田大学、庆应义塾大学合称为日本三大私立名门。
一桥大学
以商学、经济学、法学、社会学等社会科学领域著称。
私立大学
东京工业大学
理工科大学之最，专攻工程技术与自然科学。
同志社大学
综合实力强，以人文社会学科著称。
明治大学
商学、法学等领域有较高国际声誉。
立命馆大学
以国际关系、经济学、经营学等学科著称。
中央大学
综合实力强，多个学科排名靠前。
法政大学
以法学、政治学等领域著称。
以上是根据不同来源整理的日本留学热门院校推荐，你可以根据自己的兴趣和目标选择合适的学校进行申请。