本科毕业生的档案通常包含以下主要材料：
1. 个人基本信息表，如姓名、性别、出生日期等；
2. 学籍登记表，记录入学、毕业时间、成绩等；
3. 课程成绩单，显示各科成绩和学分；
4. 综合素质评价表，反映个人综合素质；
5. 推荐表，由学校出具；
6. 奖惩记录，包括获奖和处罚情况；
7. 入党积极分子培养考察登记表（如果有）；
8. 毕业证书、学位证书复印件；
9. 个人简历，包括学习、工作、实践经历等；
10. 体检表，反映身体健康状况；
11. 高考材料，如高考登记表、志愿书（电子版可能不放档案，但某些单位可能需要）；
12. 本科入学登记表、入学通知书；
13. 毕业生登记表内附成绩单（可能包含学籍登记表、学生登记表）；
14. 学位登记表；
15. 就业通知书（报到证的一部分，通常为白色，从一大张纸上撕去）。
这些材料综合反映了毕业生的教育背景、学习表现、奖惩情况、健康状况以及综合素质，是毕业生未来就业、升学、出国等重要环节中不可或缺的文件。